伤害输出能力是衡量忍者强度的决定因素指标其中一个。佩恩天道作为S级忍者，凭借其技能机制和爆发伤害长期占据伤害榜首。二技能神罗天征的8段高额伤害配合暴击效果，能在短时刻内打出极高爆发，尤其在敌人被控制时，一套连招可轻松削减对手三分之二的血量。该忍者的技能设计偏给于被动反击，需合理利用万象天引先手控制，再衔接神罗天征最大化输出效率。

除佩恩天道外，部分A级忍者在特定条件下也能打出接近S级的伤害。例如手鞠的风遁技能具备超距离和大范围优势，先手命中后可通过普攻和技能穿插形成压制；天天的超距离忍具攻击则依靠高频伤害和扫地效果持续消耗对手。这类忍者虽缺乏S级的爆发，但稳定的输出机制使其表现突出。超距离型忍者更依赖走位和技能预判，若被近身则容易陷入被动。

技能衔接和秘卷组合是提高伤害的核心诀窍。部分忍者如宇智波佐助须佐能乎或秽土转生迪达拉，需通过特定连招顺序触发高伤效果，例如先释放分身吸引注意力，再抓住时机用自爆黏土打出爆发。秘卷方面，扦插之术能固定敌人并降低防御，配合通灵兽鲛鲨或蛤蟆吉的攻击加成可进一步放大伤害。除了这些之后冻雪秘卷的冰冻效果能为后续连招创新安全环境，尤其适合缺乏控制的爆发型忍者。

实战中需综合考量忍者的伤害潜力和操作难度。高伤害忍者往往伴随技能后摇长或依赖特定条件的难题，例如佩恩天道的万象天引若未命中，会陷入较长的技能真空期。玩家需通过练习场熟悉技能判定和连招节拍，同时根据对手阵型调整策略，避免盲目追求伤害而忽略容错率。